1957.06.01.고성군 농사교도소 설치

1962.04.01.고성군 농촌지도소 개칭

1963.하일, 영현, 회화, 거류지소 설치

1975.01.18.읍면 지소설치(14개소)

1989.04.15.읍면지소 본소로 통합 12계 설치

1990.01.01.직제개편(3과12계)

1991.04.읍면농민상담소 설치(14개소)

1991.04.직제개편(3과 8계)

1992.08.직제개편(3과 8계) 및 농민상담소 직제화

1995.01.직제개편(3과 9계)

1998.09.읍면농민상담소 폐지

1998.09.19.고성군 농업기술센터로 개칭

2003.11.직제개편(3과 12담당)

2008.07.직제개편(3과 14담당)

2010.02.22.직제개편(3과 14담당, 생명환경농업연구소 3담당)

2012.07.02.직제 개편(4과 17담당)

2013.02.21.생명환경농업연구소 개소

2013.07.31.직제개편(4과 18담당)

2015.04.03.농업기술센터 신축·이전 개소 (고성읍 성내로 59 → 고성읍 남해안대로 2829-60)

2016.07.04.조직개편(4과 18담당, 농식품개발과 신설)

2019.01.01.조직개편(4과 18담당, 식품산업과 신설)